Browse
Prediction results retrieved after performance evaluation of WHO approved 34 primers to estimate their binding affinities for 3892 SARS-CoV-2 variants.

Lineage
(WHO label)
  
Target Gene
  
Primer Name
  
Primer Sequence
  
Primer Length
  
Primer GC Content (%)
  
Start Position
  
End Position
  
Primer Direction
  
ΔG (cal)
  
Primer first used
  
DV.2ORF1abYip-ORF1abTTGTTATAGCGGCCTTCTGT204519701951R-21075.5China
BT.2ORF1abYip-ORF1abTTGTTATAGCGGCCTTCTGT204519701951R-21075.5China
AY.25.2 (Delta)ORF1abYip-ORF1abTTGTTATAGCGGCCTTCTGT204519701951R-21075.5China
AY.122.6 (Delta)ORF1abYip-ORF1abTTGTTATAGCGGCCTTCTGT204519701951R-21075.5China
B.1.621.2ORF1abYip-ORF1abTTGTTATAGCGGCCTTCTGT204519701951R-21075.5China
AY.39.2 (Delta)ORF1abYip-ORF1abTTGTTATAGCGGCCTTCTGT204519701951R-21075.5China
AY.125 (Delta)ORF1abYip-ORF1abTTGTTATAGCGGCCTTCTGT204519701951R-18080China
AY.103.1 (Delta)ORF1abYip-ORF1abTTGTTATAGCGGCCTTCTGT204519701951R-21075.5China
AY.92 (Delta)ORF1abYip-ORF1abTTGTTATAGCGGCCTTCTGT204519701951R-21075.5China
AY.122.4 (Delta)ORF1abYip-ORF1abTTGTTATAGCGGCCTTCTGT204519701951R-21075.5China
AY.101 (Delta)ORF1abYip-ORF1abTTGTTATAGCGGCCTTCTGT204519701951R-21075.5China
BA.1.5ORF1abYip-ORF1abTTGTTATAGCGGCCTTCTGT204519701951R-21075.5China
Lineage
(WHO label)
  
Target Gene
  
Primer Name
  
Primer Sequence
  
Primer Length
  
Primer GC Content (%)
  
Start Position
  
End Position
  
Primer Direction
  
ΔG (cal)
  
Primer first used