Browse
Prediction results retrieved after performance evaluation of WHO approved 34 primers to estimate their binding affinities for 3892 SARS-CoV-2 variants.

Lineage
(WHO label)
  
Target Gene
  
Primer Name
  
Primer Sequence
  
Primer Length
  
Primer GC Content (%)
  
Start Position
  
End Position
  
Primer Direction
  
ΔG (cal)
  
Primer first used
  
FB.1ORF1abCharité-ORF1bCARATGTTAAASACACTATTAGCATA2623.081553015505R-9191.15Germany
FL.18.1.1ORF1abCharité-ORF1bCARATGTTAAASACACTATTAGCATA2623.081553015505R-9191.15Germany
FL.26ORF1abCharité-ORF1bCARATGTTAAASACACTATTAGCATA2623.081553015505R-9191.15Germany
EG.8ORF1abCharité-ORF1bCARATGTTAAASACACTATTAGCATA2623.081553015505R-9191.15Germany
FL.32ORF1abCharité-ORF1bCARATGTTAAASACACTATTAGCATA2623.081553015505R-9191.15Germany
FL.26.1ORF1abCharité-ORF1bCARATGTTAAASACACTATTAGCATA2623.081553015505R-9191.15Germany
EG.6ORF1abCharité-ORF1bCARATGTTAAASACACTATTAGCATA2623.081553015505R-9191.15Germany
FK.1.3.1ORF1abCharité-ORF1bCARATGTTAAASACACTATTAGCATA2623.081553015505R-9191.15Germany
FK.1.2.2ORF1abCharité-ORF1bCARATGTTAAASACACTATTAGCATA2623.081553015505R-9191.15Germany
FK.1ORF1abCharité-ORF1bCARATGTTAAASACACTATTAGCATA2623.081553015505R-9191.15Germany
CH.1.1.18ORF1abCharité-ORF1bCARATGTTAAASACACTATTAGCATA2623.081553015505R-9191.15Germany
XBB.1.5.9ORF1abCharité-ORF1bCARATGTTAAASACACTATTAGCATA2623.081553015505R-9191.15Germany
Lineage
(WHO label)
  
Target Gene
  
Primer Name
  
Primer Sequence
  
Primer Length
  
Primer GC Content (%)
  
Start Position
  
End Position
  
Primer Direction
  
ΔG (cal)
  
Primer first used