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| Prediction results retrieved after performance evaluation of WHO approved 34 primers to estimate their binding affinities for 3892 SARS-CoV-2 variants. |
| Lineage (WHO label)   | Target Gene | Primer Name | Primer Sequence | Primer Length | Primer GC Content (%) | Start Position | End Position | Primer Direction | ΔG (cal) | Primer first used |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| BQ.1.1.37 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| BN.1.4.1 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| EW.2 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| CH.1.1.17 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| XBB.2.8 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| XBF.1 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| XBP | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| CH.1.1.22 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| XBB.1.36 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| XBB.1.37 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| XBB.2.10 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| BQ.1.21 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| BN.3 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| BN.1.8 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| BQ.1.17 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| CC.1 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| BZ.1 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| CK.2 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| BF.13 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| CM.2 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| BA.5.1.4 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| BA.5.1.34 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| BQ.1.6 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| BA.2.35 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| EG.1.5 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| XBB.8 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| XAY.2.3 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| CH.1.1.8 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| BA.5.2.36 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| BV.1 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| BF.26 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| BA.5.1.33 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| CP.5 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| BA.2.45 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| BN.1.7 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| BF.5.5 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| XBB.1.41 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| BA.2.75.2 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| BA.5.1.20 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| CR.1.3 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| DV.2 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| BT.2 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| BE.1.3 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| P.1.14 (Gamma) | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| P.1.7.1 (Gamma) | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| P.1.2 (Gamma) | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| AY.112 (Delta) | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| P.1.10 (Gamma) | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| A.2.5 | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| AY.102 (Delta) | ORF1ab | Pasteur-ORF1ab-2 | GGTAACTGGTATGATTTCG | 19 | 42.11 | 14080 | 14098 | F | -18581.4 | France |
| Lineage (WHO label) | Target Gene | Primer Name | Primer Sequence | Primer Length | Primer GC Content (%) | Start Position | End Position | Primer Direction | ΔG (cal) | Primer first used |